冷庫的生物污染源主要地霉菌，因其在低溫條件下存活，對消毒劑有較強的耐受力。臭氧消毒機在冷庫的青毒菌作消毒劑篩選，在甲醛、過氧乙酸、蒼爾子油和臭氧消毒效果對比中優選出臭氧。在臭氧10ppm作用下1小時，臭氧消毒機包括低抗力極強的未萌動孢子皆被殺死。臭氧消毒機廠家實際應用效果也證明了臭氧在冷庫消毒中的優良效果。臭氧消毒機我國貯藏蛋果蔬的高溫冷庫對空庫消毒比較重視。冷庫消毒要求臭氧濃度6-10ppm，停機后封庫24小時以上，細菌殺滅率90%左右，霉菌殺滅率80%左右。臭氧消毒機這時殺菌過程長一些，現場測定停機48小時后微，生物數量還在不斷下降，而臭氧早已分解完。因此，要求臭氧消毒時間在進貨前一周安排，冷庫除味應用臭氧效果極好，短時即可奏效。用臭氧去除魚類變質臭味。
冷庫用臭氧去除魚庫的腥臭味后貯藏冰淇淋，質量很好，其它化學消毒劑的味道會污染冰淇淋。蔬菜水果貯藏保鮮是一項復雜困難的工作，臭氧可在殺菌防霉與減緩新陳代謝兩個方面發揮作用，同包裝、冷藏、氣調等手段一起配合提高保鮮效果。
臭氧殺菌防霉分三個階段應用：
1.空庫消毒
2.入庫殺菌
3.日常防霉
目的是減少霉菌、酵母菌等微生物造成腐爛。臭氧快速分解乙烯以實現減緩新陳代謝過程，推遲后熟和老化。臭氧消毒機蔬菜水果的包裝碼放在有利于臭氧接觸、擴散，紙箱側面的孔要捅開，不要碼成大垛。氣調庫與氣調。 大帳要用管道送入臭氧，自然氣調塑料袋包裝有硅窗的臭氧可以滲入，全塑袋可在換氣前后應用臭氧。
臭氧消毒因具有高效率、低消耗、使用便捷、無殘留污染物，既清潔又環保的消毒特點，已廣泛地應用于食品的生產、加工、儲存運輸、水質處理、醫藥化工、制革制藥等行業的消毒殺菌、防霉保鮮、清除異味等方面的工作。
對于儲存冷庫中的食品，例如：蘋果、梨、柑橘、草莓、各類蔬菜、雞蛋、干蘋果、土豆等等，只要控制適當的臭氧濃度，就可以實現帶貨消毒、殺菌、除霉的工作，從而延長食品的保鮮期，這是其它消毒方法難以做到的。
冷庫中堆貨往往密而高，空間空隙小，而臭氧機產生的臭氧是通過風機吹出，可彌漫到每一空間，消毒死角少。
消毒工作結束后，臭氧即開始自行分解，無殘留污染物，無須換氣除味，可避免因換氣使冷庫溫度升高和帶入新的細菌，對冷庫保濕極為有利。
冷庫高溫間多是低溫潮濕的環境，而濕度越大，微生物、霉菌等繁殖越快，食品的腐蝕也越快。雖然降低濕度可減慢細菌生長的速度，但同時又增加了食品的干耗。而臭氧的特點恰是濕度越大，殺菌力越強，能有效提高貨物在高濕度下儲存保鮮質量。
與冷庫其它消毒方法相比，滅菌率與過氧乙酸基本相同。但遠比過氧乙酸消毒方法簡便、方捷。一人按一下電鈕就可以完成整個消毒過程，而無殘留污染物。
臭氧在消除異味方面有特殊功效，在冷庫中使用，可有效地清除空氣中以及吸入墻壁、地臺板中的食品異味。避免轉存其它食品時的串味污染。
此外臭氧消毒還可用于冷庫棉衣褲集中消毒、殺菌、除味、加工間消毒、飯堂消毒及蔬菜降解農藥，廁所除臭味，以及防“非典”的消毒等等。由于臭氧消毒的綜合利用價值較高，對空庫房消毒、除味，用臭氧最好、最省、最快、最干凈，對新進貨可立即開機消毒，殺死帶入的細菌和抑制果蔬后熟時間。
正常存儲期間，可根據商品的不同采取定時或定期用臭氧消毒保鮮。（可參考冷庫技術 1993 年第三期）。
用臭氧消毒，需保持一定的濃度。一般空庫房消毒濃度可控制在 6-10 個 ppm 左右，帶貨消毒應根據食品的不同控制不同濃度，一般可控制在 4-5ppm 左右。
消毒結束后，應用塑料罩罩住整機，以減少灰塵污染。
臭氧在冷庫中的應用機理
臭氧在冷庫中的應用主要有三個方面：
①殺滅微生物?消毒殺菌；
②使各種有臭味的無機物或有機物氧化除臭；
③使新陳代謝產物氧化，從而抑制新陳代謝過程。
臭氧對細菌所產生的作用
①殺滅微生物?消毒殺菌；
雖然凍結可能會使有些細菌死亡，但有些致病菌對低溫有極大的抵抗力，一旦溫度回升，這些細菌就會“復蘇”。尤其是冷凍間及冷藏間，由于其溫度適合嗜低溫性細菌、霉菌及酵母菌的生長，會使所貯食品大量損壞。在這種情況下，使用臭氧會取得滿意效果。臭氧屬于氣體滅菌劑，其抑菌和滅菌作用，通常是物理的、化學的及生物學等方面的綜合結果。其作用機制可歸納為以下三點：a.作用于細胞膜、導致細胞膜的通透性增加、細胞內物質外流，使細胞失去活力；b.使細胞活動必需的酶失去活性。這些酶既可以是基礎代謝的酶，也可以是合成細胞重要萬分的酶；c.破壞細胞質人的遺傳物質或使其失去功能。一般認為，臭氧殺滅病毒是通過直接破壞其RNA（核糖核酸）或DNA（脫氧核糖核酸）物質完成的。而臭氧殺滅細菌，霉菌類微生物則是臭氧首先作用于細胞膜，使細胞膜的構成受到損傷，導致新陳代謝障礙并抑制其生長。臭氧繼續滲透破壞膜內組織，直至死亡。
②使各種有臭味的無機物或有機物氧化—除臭；
臭氧本身有特殊的氣味。利用臭氧來除臭味，并不是以臭氧的氣味來掩蓋其他臭味，而主要是利用臭氧的強氧化能力。臭味的主要成份是胺R3N，硫化氰H2S，甲硫醇CH3SH二甲硫化物CH3SCH3，二甲二硫化物CH3-S-S-CH3等。
③使新陳代謝產物氧化，從而抑制新陳代謝過程。
在果蔬貯藏過程中，會產生乙烯。會影響到其他果蔬，使果蔬進一步成熟。這過程的起始現象是表皮變褐，果肉變軟，最終腐爛。利用臭氧可使乙烯氧化，變成CO2和水。
臭氧發生器選用按以下方法計算：
以上凈化空間僅供參考，具體可以按客戶提供空間大小，客戶要求凈化級別，按公式計算，得出臭氧投加量。
根據《消毒技術規范》。
三十萬凈化級取C = 2.5ppm = 5mg/m3；
十萬凈化級級取C = 5ppm = 10mg/ m3；
萬凈化級取C = 15ppm = 30mg/ m3；
百級取C = 20ppm = 40mg/ m3。
首先計算實際臭氧消毒體積，實際體積由三部分組成V = V1 ，V1潔凈區空間體積，V2空氣凈化系統體積。
（1）W = c×v/d
w：實際選用臭氧發生器的產量，單位為g/h。c：單位體積臭氧投加量。V：實際臭氧消毒體積。d：臭氧衰退系數0.4208。
（2）若設計臭氧濃度按空間浮游菌為5ppm，消毒體積10000m3。
V1=10000 m3
實際臭氧消毒體積V = V1 =1000m3
臭氧投加量W = C×V/d = 10×10000/0.4208 = 237.64g/h
推薦選擇臭氧發生器的產量為250g/h.
